Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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