Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USF2Q15853 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USF2Q15853 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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