Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B3Q15393 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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