Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
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