Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDCD1Q15116 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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