Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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