Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSPNQ14714 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSPNQ14714 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms