Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms