Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM53BQ14153 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM53BQ14153 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms