Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A2Q14055 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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