Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CKAP5Q14008 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CKAP5Q14008 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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