Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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