Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL3Q13618 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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