Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PEX6Q13608 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PEX6Q13608 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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