Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PICALMQ13492 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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