Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B2Q13435 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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