Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLN3Q13286 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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