Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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