Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSPB3Q12988 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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