Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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BNIP1Q12981 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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BNIP1Q12981 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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BNIP1Q12981 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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