Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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KCNMA1Q12791 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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