Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms