Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 SWI4YER111C 3282 nt1.87□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 PET111YMR257C 2403 nt1.86□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 IML1YJR138W 4755 nt1.86□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 SPC110YDR356W 2835 nt1.84□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 BPH1YCR032W 6504 nt1.83□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 UBP2YOR124C 3819 nt1.83□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 EST2YLR318W 2655 nt1.82□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 BST1YFL025C 3090 nt1.82□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.81□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.81□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 MON2YNL297C 4911 nt1.81□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 CDC39YCR093W 6327 nt1.79□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 BUL2YML111W 2763 nt1.78□□□□□ -2.12
SRF1Q12516 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.77□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 UTP20YBL004W 7482 nt1.75□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.74□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 SIP4YJL089W 2490 nt1.74□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 DOP1YDR141C 5097 nt1.73□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 NUP188YML103C 4968 nt1.72□□□□□ -2.13
SRF1Q12516 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.71□□□□□ -2.14
SRF1Q12516 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.65□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.64□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 SPT7YBR081C 3999 nt1.63□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.62□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.6□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.6□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.59□□□□□ -2.15
SRF1Q12516 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.57□□□□□ -2.16
SRF1Q12516 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.54□□□□□ -2.16
SRF1Q12516 IRA1YBR140C 9279 nt1.51□□□□□ -2.17
SRF1Q12516 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.5□□□□□ -2.17
SRF1Q12516 YOL014WYOL014W 375 nt1.49□□□□□ -2.17
SRF1Q12516 MYO1YHR023W 5787 nt1.44□□□□□ -2.18
SRF1Q12516 snR67snR67 82 nt1.44□□□□□ -2.18
SRF1Q12516 YPR117WYPR117W 7470 nt1.43□□□□□ -2.18
SRF1Q12516 VAM6YDL077C 3150 nt1.41□□□□□ -2.18
SRF1Q12516 MLP2YIL149C 5040 nt1.37□□□□□ -2.19
SRF1Q12516 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.36□□□□□ -2.19
SRF1Q12516 HKR1YDR420W 5409 nt1.35□□□□□ -2.19
SRF1Q12516 snR40snR40 97 nt1.33□□□□□ -2.2
SRF1Q12516 YMR160WYMR160W 2451 nt1.32□□□□□ -2.2
SRF1Q12516 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.31□□□□□ -2.2
SRF1Q12516 RKR1YMR247C 4689 nt1.29□□□□□ -2.2
SRF1Q12516 BUD3YCL014W 4911 nt1.28□□□□□ -2.2
SRF1Q12516 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
SRF1Q12516 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.23□□□□□ -2.21
SRF1Q12516 SCC2YDR180W 4482 nt1.21□□□□□ -2.22
SRF1Q12516 LTE1YAL024C 4308 nt1.18□□□□□ -2.22
SRF1Q12516 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.18□□□□□ -2.22
SRF1Q12516 THO2YNL139C 4794 nt1.09□□□□□ -2.23
SRF1Q12516 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.08□□□□□ -2.24
SRF1Q12516 snR77snR77 88 nt1.07□□□□□ -2.24
SRF1Q12516 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.03□□□□□ -2.24
SRF1Q12516 SOV1YMR066W 2697 nt1.03□□□□□ -2.24
SRF1Q12516 EMT1tM(CAU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 EMT4tM(CAU)M 73 nt1□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 IQG1YPL242C 4488 nt0.99□□□□□ -2.25
SRF1Q12516 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
SRF1Q12516 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
SRF1Q12516 SBH2YER019C-A 267 nt0.94□□□□□ -2.26
SRF1Q12516 BEM2YER155C 6504 nt0.93□□□□□ -2.26
SRF1Q12516 MLP1YKR095W 5628 nt0.9□□□□□ -2.26
SRF1Q12516 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 FMP27YLR454W 7887 nt0.87□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 ESP1YGR098C 4893 nt0.87□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 YJL113WYJL113W 4647 nt0.84□□□□□ -2.27
SRF1Q12516 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
SRF1Q12516 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.8□□□□□ -2.28
SRF1Q12516 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
SRF1Q12516 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
SRF1Q12516 PAU9YBL108C-A 129 nt0.53□□□□□ -2.32
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