Protein–RNA interactions for Protein: Q12412

PNS1, Protein PNS1, yeastyeast

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNS1Q12412 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.37□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 SKI7YOR076C 2244 nt1.37□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 SEC8YPR055W 3198 nt1.37□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 NUP188YML103C 4968 nt1.35□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.34□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 RDS3YPR094W 324 nt1.34□□□□□ -2.19
PNS1Q12412 ROM2YLR371W 4071 nt1.34□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 YCS4YLR272C 3531 nt1.34□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.34□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 SWI4YER111C 3282 nt1.33□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.33□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 BST1YFL025C 3090 nt1.32□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 YSP1YHR155W 3687 nt1.32□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 HKR1YDR420W 5409 nt1.29□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 LAA1YJL207C 6045 nt1.28□□□□□ -2.2
PNS1Q12412 MSN5YDR335W 3675 nt1.27□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 IML1YJR138W 4755 nt1.26□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 BUD3YCL014W 4911 nt1.25□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 PET111YMR257C 2403 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.24□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 EST2YLR318W 2655 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 BUL2YML111W 2763 nt1.22□□□□□ -2.21
PNS1Q12412 CDC25YLR310C 4770 nt1.21□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 SIP4YJL089W 2490 nt1.2□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.19□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.18□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.17□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 YJR029WYJR029W 5268 nt1.15□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.22
PNS1Q12412 YOL014WYOL014W 375 nt1.11□□□□□ -2.23
PNS1Q12412 SPT7YBR081C 3999 nt1.11□□□□□ -2.23
PNS1Q12412 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.1□□□□□ -2.23
PNS1Q12412 RKR1YMR247C 4689 nt1.09□□□□□ -2.23
PNS1Q12412 DOP1YDR141C 5097 nt1.09□□□□□ -2.23
PNS1Q12412 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.06□□□□□ -2.24
PNS1Q12412 VAM6YDL077C 3150 nt1.05□□□□□ -2.24
PNS1Q12412 UTP20YBL004W 7482 nt1.05□□□□□ -2.24
PNS1Q12412 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
PNS1Q12412 snR67snR67 82 nt0.98□□□□□ -2.25
PNS1Q12412 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
PNS1Q12412 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.96□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.96□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 YPR117WYPR117W 7470 nt0.96□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.95□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 MLP2YIL149C 5040 nt0.92□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 YMR160WYMR160W 2451 nt0.91□□□□□ -2.26
PNS1Q12412 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.9□□□□□ -2.27
PNS1Q12412 THO2YNL139C 4794 nt0.83□□□□□ -2.28
PNS1Q12412 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.81□□□□□ -2.28
PNS1Q12412 LTE1YAL024C 4308 nt0.8□□□□□ -2.28
PNS1Q12412 snR40snR40 97 nt0.79□□□□□ -2.28
PNS1Q12412 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.68□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 snR77snR77 88 nt0.67□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 IQG1YPL242C 4488 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PNS1Q12412 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.64□□□□□ -2.31
PNS1Q12412 SOV1YMR066W 2697 nt0.63□□□□□ -2.31
PNS1Q12412 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
PNS1Q12412 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
PNS1Q12412 SBH2YER019C-A 267 nt0.57□□□□□ -2.32
PNS1Q12412 MLP1YKR095W 5628 nt0.57□□□□□ -2.32
PNS1Q12412 FMP27YLR454W 7887 nt0.55□□□□□ -2.32
PNS1Q12412 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.53□□□□□ -2.32
PNS1Q12412 ESP1YGR098C 4893 nt0.47□□□□□ -2.33
PNS1Q12412 PAU9YBL108C-A 129 nt0.41□□□□□ -2.34
PNS1Q12412 snR128snR128 126 nt0.35□□□□□ -2.35
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