Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt2.58□□□□□ -2
DIP2Q12220 snR67snR67 82 nt2.57□□□□□ -2
DIP2Q12220 YGR130CYGR130C 2451 nt2.57□□□□□ -2
DIP2Q12220 SPT7YBR081C 3999 nt2.55□□□□□ -2
DIP2Q12220 CFT1YDR301W 4074 nt2.51□□□□□ -2.01
DIP2Q12220 SPC110YDR356W 2835 nt2.5□□□□□ -2.01
DIP2Q12220 PEP1YBL017C 4740 nt2.48□□□□□ -2.01
DIP2Q12220 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.47□□□□□ -2.01
DIP2Q12220 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.45□□□□□ -2.02
DIP2Q12220 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.43□□□□□ -2.02
DIP2Q12220 DGR1YNL130C-A 147 nt2.43□□□□□ -2.02
DIP2Q12220 YMR045CYMR045C 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
DIP2Q12220 SPP41YDR464W 4308 nt2.41□□□□□ -2.02
DIP2Q12220 DNF1YER166W 4716 nt2.4□□□□□ -2.03
DIP2Q12220 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.38□□□□□ -2.03
DIP2Q12220 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.36□□□□□ -2.03
DIP2Q12220 FAB1YFR019W 6837 nt2.34□□□□□ -2.03
DIP2Q12220 SSK2YNR031C 4740 nt2.33□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 YMR160WYMR160W 2451 nt2.32□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.32□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 snR40snR40 97 nt2.31□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 FKS1YLR342W 5631 nt2.31□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 VAM6YDL077C 3150 nt2.3□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 YOR093CYOR093C 4947 nt2.29□□□□□ -2.04
DIP2Q12220 BRR2YER172C 6492 nt2.25□□□□□ -2.05
DIP2Q12220 YPR117WYPR117W 7470 nt2.21□□□□□ -2.06
DIP2Q12220 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.2□□□□□ -2.06
DIP2Q12220 LTE1YAL024C 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
DIP2Q12220 CCH1YGR217W 6120 nt2.12□□□□□ -2.07
DIP2Q12220 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt2.09□□□□□ -2.08
DIP2Q12220 FIG2YCR089W 4830 nt2.09□□□□□ -2.08
DIP2Q12220 MEC1YBR136W 7107 nt2.06□□□□□ -2.08
DIP2Q12220 VPS15YBR097W 4365 nt2.04□□□□□ -2.08
DIP2Q12220 DNF3YMR162C 4971 nt2.03□□□□□ -2.08
DIP2Q12220 SCC2YDR180W 4482 nt1.95□□□□□ -2.1
DIP2Q12220 RKR1YMR247C 4689 nt1.94□□□□□ -2.1
DIP2Q12220 IRA1YBR140C 9279 nt1.93□□□□□ -2.1
DIP2Q12220 BUD3YCL014W 4911 nt1.91□□□□□ -2.1
DIP2Q12220 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.87□□□□□ -2.11
DIP2Q12220 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.86□□□□□ -2.11
DIP2Q12220 snR77snR77 88 nt1.85□□□□□ -2.11
DIP2Q12220 YJR029WYJR029W 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
DIP2Q12220 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.84□□□□□ -2.12
DIP2Q12220 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.81□□□□□ -2.12
DIP2Q12220 PAU24YBR301W 363 nt1.81□□□□□ -2.12
DIP2Q12220 HKR1YDR420W 5409 nt1.8□□□□□ -2.12
DIP2Q12220 MLP1YKR095W 5628 nt1.77□□□□□ -2.13
DIP2Q12220 BEM2YER155C 6504 nt1.77□□□□□ -2.13
DIP2Q12220 IML1YJR138W 4755 nt1.73□□□□□ -2.13
DIP2Q12220 SBH2YER019C-A 267 nt1.71□□□□□ -2.14
DIP2Q12220 DOP1YDR141C 5097 nt1.68□□□□□ -2.14
DIP2Q12220 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.67□□□□□ -2.14
DIP2Q12220 IQG1YPL242C 4488 nt1.67□□□□□ -2.14
DIP2Q12220 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.62□□□□□ -2.15
DIP2Q12220 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.55□□□□□ -2.16
DIP2Q12220 MYO1YHR023W 5787 nt1.51□□□□□ -2.17
DIP2Q12220 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.48□□□□□ -2.17
DIP2Q12220 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.48□□□□□ -2.17
DIP2Q12220 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.42□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 SOV1YMR066W 2697 nt1.41□□□□□ -2.18
DIP2Q12220 ESP1YGR098C 4893 nt1.35□□□□□ -2.19
DIP2Q12220 UTP20YBL004W 7482 nt1.34□□□□□ -2.19
DIP2Q12220 YJL113WYJL113W 4647 nt1.34□□□□□ -2.2
DIP2Q12220 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.26□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.26□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.26□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.26□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.26□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 YOL014WYOL014W 375 nt1.23□□□□□ -2.21
DIP2Q12220 THO2YNL139C 4794 nt1.2□□□□□ -2.22
DIP2Q12220 FMP27YLR454W 7887 nt1.19□□□□□ -2.22
DIP2Q12220 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt1.11□□□□□ -2.23
DIP2Q12220 PAU9YBL108C-A 129 nt1.09□□□□□ -2.23
DIP2Q12220 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.03□□□□□ -2.24
DIP2Q12220 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt1.02□□□□□ -2.25
DIP2Q12220 snR128snR128 126 nt0.95□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 UTP10YJL109C 5310 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
DIP2Q12220 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms