Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 RPS26AYGL189C 360 nt0.66□□□□□ -2.3
SLX4Q12098 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
SLX4Q12098 CSE1YGL238W 2883 nt0.65□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 snR39BsnR39B 96 nt0.63□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 SBH1YER087C-B 249 nt0.62□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 BUL2YML111W 2763 nt0.62□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 MLP2YIL149C 5040 nt0.61□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.6□□□□□ -2.31
SLX4Q12098 ORC3YLL004W 1851 nt0.58□□□□□ -2.32
SLX4Q12098 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.56□□□□□ -2.32
SLX4Q12098 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
SLX4Q12098 RCO1YMR075W 2055 nt0.52□□□□□ -2.33
SLX4Q12098 BIR1YJR089W 2865 nt0.5□□□□□ -2.33
SLX4Q12098 AI1Q0050 2505 nt0.48□□□□□ -2.33
SLX4Q12098 MYO1YHR023W 5787 nt0.46□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 YGR164WYGR164W 336 nt0.45□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 YNL205CYNL205C 423 nt0.44□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.44□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 YBR099CYBR099C 384 nt0.44□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.44□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 THO2YNL139C 4794 nt0.41□□□□□ -2.34
SLX4Q12098 SOM1YEL059C-A 225 nt0.4□□□□□ -2.35
SLX4Q12098 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.39□□□□□ -2.35
SLX4Q12098 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.36□□□□□ -2.35
SLX4Q12098 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.36□□□□□ -2.35
SLX4Q12098 PMP2YEL017C-A 132 nt0.35□□□□□ -2.35
SLX4Q12098 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 EST1YLR233C 2100 nt0.34□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.33□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 snR69snR69 101 nt0.32□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 YNL170WYNL170W 396 nt0.29□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 SEC10YLR166C 2616 nt0.29□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.28□□□□□ -2.36
SLX4Q12098 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.28□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 ATP8Q0080 147 nt0.26□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.26□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 YNL266WYNL266W 420 nt0.26□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.25□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 RDS3YPR094W 324 nt0.25□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.22□□□□□ -2.37
SLX4Q12098 YBR178WYBR178W 375 nt0.19□□□□□ -2.38
SLX4Q12098 Q0092Q0092 141 nt0.18□□□□□ -2.38
SLX4Q12098 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.18□□□□□ -2.38
SLX4Q12098 SOV1YMR066W 2697 nt0.18□□□□□ -2.38
SLX4Q12098 snR128snR128 126 nt0.12□□□□□ -2.39
SLX4Q12098 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.11□□□□□ -2.39
SLX4Q12098 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.09□□□□□ -2.4
SLX4Q12098 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.08□□□□□ -2.4
SLX4Q12098 snR45snR45 172 nt0.08□□□□□ -2.4
SLX4Q12098 snR50snR50 90 nt0.02□□□□□ -2.41
SLX4Q12098 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.01□□□□□ -2.41
SLX4Q12098 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.06□□□□□ -2.42
SLX4Q12098 snR67snR67 82 nt-0.14□□□□□ -2.43
SLX4Q12098 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.14□□□□□ -2.43
SLX4Q12098 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.15□□□□□ -2.43
SLX4Q12098 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.15□□□□□ -2.43
SLX4Q12098 SBH2YER019C-A 267 nt-0.17□□□□□ -2.44
SLX4Q12098 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.17□□□□□ -2.44
SLX4Q12098 snR61snR61 90 nt-0.19□□□□□ -2.44
SLX4Q12098 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.21□□□□□ -2.44
SLX4Q12098 snR81snR81 201 nt-0.23□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.23□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.23□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.24□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.25□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 Q0143Q0143 153 nt-0.25□□□□□ -2.45
SLX4Q12098 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.3□□□□□ -2.46
SLX4Q12098 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.31□□□□□ -2.46
SLX4Q12098 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.33□□□□□ -2.46
SLX4Q12098 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.35□□□□□ -2.47
SLX4Q12098 SKI7YOR076C 2244 nt-0.4□□□□□ -2.47
SLX4Q12098 snR85snR85 171 nt-0.42□□□□□ -2.48
SLX4Q12098 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.43□□□□□ -2.48
SLX4Q12098 snR47snR47 99 nt-0.44□□□□□ -2.48
SLX4Q12098 RPL41AYDL184C 78 nt-0.45□□□□□ -2.48
SLX4Q12098 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.48□□□□□ -2.49
SLX4Q12098 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.48□□□□□ -2.49
SLX4Q12098 YMR326CYMR326C 309 nt-0.52□□□□□ -2.49
SLX4Q12098 URB1YKL014C 5295 nt-0.53□□□□□ -2.49
SLX4Q12098 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.56□□□□□ -2.5
SLX4Q12098 snR161snR161 161 nt-0.56□□□□□ -2.5
SLX4Q12098 snR62snR62 100 nt-0.62□□□□□ -2.51
SLX4Q12098 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.62□□□□□ -2.51
SLX4Q12098 YHR217CYHR217C 462 nt-0.62□□□□□ -2.51
SLX4Q12098 snR33snR33 183 nt-0.64□□□□□ -2.51
SLX4Q12098 snR38snR38 95 nt-0.64□□□□□ -2.51
SLX4Q12098 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.67□□□□□ -2.52
SLX4Q12098 YBL109WYBL109W 336 nt-0.72□□□□□ -2.52
SLX4Q12098 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.73□□□□□ -2.53
SLX4Q12098 YKL225WYKL225W 348 nt-0.76□□□□□ -2.53
SLX4Q12098 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.76□□□□□ -2.53
SLX4Q12098 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
SLX4Q12098 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SLX4Q12098 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SLX4Q12098 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
SLX4Q12098 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
SLX4Q12098 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.9□□□□□ -2.55
SLX4Q12098 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.94□□□□□ -2.56
SLX4Q12098 YNR077CYNR077C 255 nt-0.94□□□□□ -2.56
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