Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms