Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD3Q0VAK6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD3Q0VAK6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms