Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GOLGA3Q08378 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GOLGA3Q08378 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms