Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms