Protein–RNA interactions for Protein: Q07845

GRC3, Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase GRC3, yeastyeast

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GRC3Q07845 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.57□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 ORC3YLL004W 1851 nt0.55□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 MLP2YIL149C 5040 nt0.55□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 HUG1YML058W-A 207 nt0.54□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 YNL205CYNL205C 423 nt0.54□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 YBR099CYBR099C 384 nt0.54□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 RCO1YMR075W 2055 nt0.53□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 CSE1YGL238W 2883 nt0.53□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 BIR1YJR089W 2865 nt0.53□□□□□ -2.32
GRC3Q07845 YMR160WYMR160W 2451 nt0.52□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 SBH1YER087C-B 249 nt0.52□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.51□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 UTP20YBL004W 7482 nt0.49□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 Q0143Q0143 153 nt0.48□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 YNL266WYNL266W 420 nt0.48□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 PMP2YEL017C-A 132 nt0.47□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.47□□□□□ -2.33
GRC3Q07845 EST1YLR233C 2100 nt0.46□□□□□ -2.34
GRC3Q07845 snR69snR69 101 nt0.44□□□□□ -2.34
GRC3Q07845 YBR178WYBR178W 375 nt0.44□□□□□ -2.34
GRC3Q07845 SEC10YLR166C 2616 nt0.43□□□□□ -2.34
GRC3Q07845 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.41□□□□□ -2.34
GRC3Q07845 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.39□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 snR85snR85 171 nt0.38□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.38□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.38□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.37□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 FMP27YLR454W 7887 nt0.36□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.36□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.35□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 RDS3YPR094W 324 nt0.35□□□□□ -2.35
GRC3Q07845 ESP1YGR098C 4893 nt0.34□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 snR61snR61 90 nt0.32□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.31□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.3□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 SOV1YMR066W 2697 nt0.28□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
GRC3Q07845 snR81snR81 201 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 TFB5YDR079C-A 219 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YOL014WYOL014W 375 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 AI1Q0050 2505 nt0.27□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.24□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 snR50snR50 90 nt0.24□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.23□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.23□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.23□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.22□□□□□ -2.37
GRC3Q07845 YBL109WYBL109W 336 nt0.19□□□□□ -2.38
GRC3Q07845 THO2YNL139C 4794 nt0.18□□□□□ -2.38
GRC3Q07845 YMR326CYMR326C 309 nt0.14□□□□□ -2.39
GRC3Q07845 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.12□□□□□ -2.39
GRC3Q07845 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.12□□□□□ -2.39
GRC3Q07845 YHR217CYHR217C 462 nt0.11□□□□□ -2.39
GRC3Q07845 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.09□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 snR128snR128 126 nt0.09□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.08□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.07□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.06□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 snR67snR67 82 nt0.05□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.05□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.03□□□□□ -2.4
GRC3Q07845 snR47snR47 99 nt0.02□□□□□ -2.41
GRC3Q07845 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0□□□□□ -2.41
GRC3Q07845 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.02□□□□□ -2.41
GRC3Q07845 snR62snR62 100 nt-0.03□□□□□ -2.41
GRC3Q07845 SKI7YOR076C 2244 nt-0.05□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 snR45snR45 172 nt-0.07□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 RPL41AYDL184C 78 nt-0.08□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.08□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 snR38snR38 95 nt-0.09□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.09□□□□□ -2.42
GRC3Q07845 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.12□□□□□ -2.43
GRC3Q07845 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.15□□□□□ -2.43
GRC3Q07845 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.16□□□□□ -2.44
GRC3Q07845 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.17□□□□□ -2.44
GRC3Q07845 YKL225WYKL225W 348 nt-0.19□□□□□ -2.44
GRC3Q07845 SBH2YER019C-A 267 nt-0.2□□□□□ -2.44
GRC3Q07845 snR64snR64 101 nt-0.32□□□□□ -2.46
GRC3Q07845 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.32□□□□□ -2.46
GRC3Q07845 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.32□□□□□ -2.46
GRC3Q07845 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.36□□□□□ -2.47
GRC3Q07845 URB1YKL014C 5295 nt-0.38□□□□□ -2.47
GRC3Q07845 snR161snR161 161 nt-0.41□□□□□ -2.48
GRC3Q07845 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.43□□□□□ -2.48
GRC3Q07845 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.47□□□□□ -2.48
GRC3Q07845 snR53snR53 91 nt-0.5□□□□□ -2.49
GRC3Q07845 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.51□□□□□ -2.49
GRC3Q07845 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.53□□□□□ -2.49
GRC3Q07845 snR77snR77 88 nt-0.6□□□□□ -2.51
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