Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms