Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms