Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FMODQ06828 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FMODQ06828 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms