Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms