Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE3AQ05086 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms