Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms