Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms