Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORDQ00796 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORDQ00796 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORDQ00796 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORDQ00796 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORDQ00796 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORDQ00796 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORDQ00796 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORDQ00796 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORDQ00796 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms