Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms