Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms