Protein–RNA interactions for Protein: P53858

BNI4, Protein BNI4, yeastyeast

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BNI4P53858 CAT8YMR280C 4302 nt1.95□□□□□ -2.1
BNI4P53858 SWI4YER111C 3282 nt1.95□□□□□ -2.1
BNI4P53858 PMD1YER132C 5262 nt1.95□□□□□ -2.1
BNI4P53858 SPC110YDR356W 2835 nt1.93□□□□□ -2.1
BNI4P53858 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.91□□□□□ -2.1
BNI4P53858 TRM732YMR259C 4263 nt1.91□□□□□ -2.1
BNI4P53858 VPS15YBR097W 4365 nt1.9□□□□□ -2.11
BNI4P53858 NUP145YGL092W 3954 nt1.9□□□□□ -2.11
BNI4P53858 PEP1YBL017C 4740 nt1.88□□□□□ -2.11
BNI4P53858 NUP188YML103C 4968 nt1.87□□□□□ -2.11
BNI4P53858 FIG2YCR089W 4830 nt1.87□□□□□ -2.11
BNI4P53858 IRA1YBR140C 9279 nt1.86□□□□□ -2.11
BNI4P53858 MYO1YHR023W 5787 nt1.86□□□□□ -2.11
BNI4P53858 MEC1YBR136W 7107 nt1.85□□□□□ -2.11
BNI4P53858 DNF3YMR162C 4971 nt1.85□□□□□ -2.11
BNI4P53858 NUP192YJL039C 5052 nt1.84□□□□□ -2.11
BNI4P53858 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.84□□□□□ -2.11
BNI4P53858 snR67snR67 82 nt1.83□□□□□ -2.12
BNI4P53858 SSK2YNR031C 4740 nt1.83□□□□□ -2.12
BNI4P53858 LAA1YJL207C 6045 nt1.82□□□□□ -2.12
BNI4P53858 CLU1YMR012W 3834 nt1.81□□□□□ -2.12
BNI4P53858 CDC39YCR093W 6327 nt1.79□□□□□ -2.12
BNI4P53858 YMR160WYMR160W 2451 nt1.74□□□□□ -2.13
BNI4P53858 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.74□□□□□ -2.13
BNI4P53858 CFT1YDR301W 4074 nt1.71□□□□□ -2.13
BNI4P53858 BRR2YER172C 6492 nt1.7□□□□□ -2.14
BNI4P53858 BST1YFL025C 3090 nt1.7□□□□□ -2.14
BNI4P53858 YGR130CYGR130C 2451 nt1.68□□□□□ -2.14
BNI4P53858 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.65□□□□□ -2.15
BNI4P53858 VAM6YDL077C 3150 nt1.61□□□□□ -2.15
BNI4P53858 SPT7YBR081C 3999 nt1.6□□□□□ -2.15
BNI4P53858 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.57□□□□□ -2.16
BNI4P53858 BUD3YCL014W 4911 nt1.53□□□□□ -2.16
BNI4P53858 YPR117WYPR117W 7470 nt1.53□□□□□ -2.16
BNI4P53858 MLP2YIL149C 5040 nt1.53□□□□□ -2.16
BNI4P53858 CCH1YGR217W 6120 nt1.53□□□□□ -2.17
BNI4P53858 HKR1YDR420W 5409 nt1.52□□□□□ -2.17
BNI4P53858 snR77snR77 88 nt1.5□□□□□ -2.17
BNI4P53858 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
BNI4P53858 RKR1YMR247C 4689 nt1.44□□□□□ -2.18
BNI4P53858 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.41□□□□□ -2.18
BNI4P53858 IML1YJR138W 4755 nt1.39□□□□□ -2.19
BNI4P53858 SOV1YMR066W 2697 nt1.33□□□□□ -2.2
BNI4P53858 LTE1YAL024C 4308 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 SBH2YER019C-A 267 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.32□□□□□ -2.2
BNI4P53858 YJR029WYJR029W 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
BNI4P53858 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.29□□□□□ -2.2
BNI4P53858 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.29□□□□□ -2.2
BNI4P53858 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.25□□□□□ -2.21
BNI4P53858 PAU24YBR301W 363 nt1.25□□□□□ -2.21
BNI4P53858 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.18□□□□□ -2.22
BNI4P53858 SCC2YDR180W 4482 nt1.16□□□□□ -2.22
BNI4P53858 THO2YNL139C 4794 nt1.15□□□□□ -2.23
BNI4P53858 BEM2YER155C 6504 nt1.08□□□□□ -2.24
BNI4P53858 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
BNI4P53858 UTP20YBL004W 7482 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
BNI4P53858 ESP1YGR098C 4893 nt0.97□□□□□ -2.25
BNI4P53858 MLP1YKR095W 5628 nt0.97□□□□□ -2.25
BNI4P53858 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.96□□□□□ -2.26
BNI4P53858 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.9□□□□□ -2.27
BNI4P53858 PAU9YBL108C-A 129 nt0.89□□□□□ -2.27
BNI4P53858 IQG1YPL242C 4488 nt0.84□□□□□ -2.27
BNI4P53858 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
BNI4P53858 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.8□□□□□ -2.28
BNI4P53858 FMP27YLR454W 7887 nt0.78□□□□□ -2.28
BNI4P53858 YOL014WYOL014W 375 nt0.78□□□□□ -2.28
BNI4P53858 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.78□□□□□ -2.28
BNI4P53858 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.77□□□□□ -2.29
BNI4P53858 UTP10YJL109C 5310 nt0.74□□□□□ -2.29
BNI4P53858 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
BNI4P53858 snR6snR6 112 nt0.71□□□□□ -2.3
BNI4P53858 YJL113WYJL113W 4647 nt0.71□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
BNI4P53858 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms