Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PGGT1BP53609 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PGGT1BP53609 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PGGT1BP53609 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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