Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms