Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCNKBP51801 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCNKBP51801 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLCNKBP51801 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCNKBP51801 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCNKBP51801 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLCNKBP51801 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCNKBP51801 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCNKBP51801 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms