Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPT1P50897 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms