Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF6P49848 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF6P49848 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF6P49848 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF6P49848 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms