Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPFP49454 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPFP49454 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPFP49454 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPFP49454 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms