Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARRB1P49407 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms