Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms